مقال عام01
تسلسل الجينوم الكامل (Whole-Genome Sequencing): من البيانات الخام إلى اكتشاف المتغيرات الوراثية
يقدم هذا المقال مدخلًا إلى تقنية تسلسل الجينوم الكامل (WGS)، وأهم تطبيقاتها في دراسة الأمراض الوراثية والسرطان والطب الدقيق. كما يستعرض المراحل الأساسية لتحليل البيانات الجينومية، من محاذاة القراءات واكتشاف المتغيرات الوراثية إلى تنقيتها وتوصيفها. ويناقش محدودية الجينوم المرجعي الحالي والانحياز الناتج عن نقص تمثيل بعض المجموعات السكانية، مع تسليط الضوء على أبرز مشاريع الجينوم الوطنية في العالم العربي ودورها في فهم التنوع الوراثي وتطوير الطب الدقيق.
اقرأ المقال ←أحياء02
تقنيات دراسة الاماكن المفتوحة في الجينوم (تنميط اتاحة الكروماتين)
السلام عليكم ورحمة الله تعالى وبركاته, تكلمنا في مقالات سابقة عن بعض مفاهيم علم الوراثة اللاجينية (epigenetics), كالتعديلات الاجينية التي تتم عن طريق ارتباط البروتينات بالجينوم أو التغيرات ا
اقرأ المقال ←برمجة03
مدخل الى مجال تحليل الخلايا المفردة ( الجزء الثالث)
في الجزئين الاولين من هذه السلسلة (هنا وهنا) قمنا بشرح بعض المفاهيم الأساسية لمجال الـ Single-cell Sequencing وبينا كيفية الحصول على البيانات الاولية المتمثلة في مصفوفة التعبير الجيني. على ا
اقرأ المقال ←برمجة04
انشاء خطوط تحليل البيانات باستعمال bpipe
عند تحليل البيانات في العادة نستعمل اكثر من أدات واحدة للحصول على النتيجة او النتائج النهائية . مثلا عند حساب التعبير الجيني يجب اولا ان نقوم بحساب جودة السلاسل باستعمال fastqc، بعدها نقوم ب
اقرأ المقال ←تقنيات05
البنية ثلاثية الأبعاد للجينوم
من بين التصورات التي ترسبت لدينا من المقررات الدراسية و حتى الجامعية لدى تخيلنا لعلمية النسخ هو أن للحمض النووي بنية خطية تلتصق بها بروتينات و أنزيمات مختلفة كالأرنا بوليميراز II ومجموعة من
اقرأ المقال ←تقنيات06
تحليل بيانات الترسيب المناعي ChIP-Seq
في مَقَال سَابق عرَّفنا بواحدة من اهم التقنيات المستعملة في مجال البيولوجيا و التي نتعامل مع بيانتها كثيرا في مجال المعلوماتية الحيوية والمتمثلة في تقنية الترسيب المناعي للكروماتين المتبوعة
اقرأ المقال ←
